随着医疗水平的不断提高，手术与溶石、溶石与排石相结合的方法在临床上被广泛采用，使肝内胆管结石的治疗不仅更具有针对性和准确性，同时还更加安全、有效。
正生结石网表示：治疗胆管结石的方法越来越多，但是对症下药也很重要，不同的病情是需要不同的治疗方法。
1、周围型肝内胆管结石，无明显症状，无需手术治疗。
2、肝左叶胆管结石，肝外胆管无扩张也无结石，宜施肝左外叶切除术，保护并显露左外叶胆管汇合部，并经汇合部切开取出左内叶胆管结石，再修复汇合部的胆道。不必探查胆总管。
3、合并肝总管结石和胆道扩张者，切开胆总管探查取石。术中用胆道镜取石，也可以用Fogarty导管取肝内胆管结石，留置合适T管引流。术后半月行B超和T管造影，判断有无结石残留。如有的话，应该在手术6周后再用胆道镜取石。
4、合并肝门部胆管(1级)狭窄者，应于术中显露肝门部左右肝管，切开狭窄处，解除狭窄，取出结石，行肝门胆管空肠Roux-en-Y吻合术，同时切除胆囊。
5、右半肝内胆管结石合并肝萎缩，而左半肝正常者，可切除萎缩的右半肝。
6、全肝内胆管充满结石，根本无法取净，且肝功能损害有生命危险者，可考虑肝移植。
7、合并肝内胆管炎时，应积极应用抗生素，控制感染。重症感染时，也应手术探查胆道，解除梗阻，取石并引流治疗，条件许可者也可同时去除病灶。
